Desde 1993, Khanna ha sido profesor de la Escuela de Negocios de Harvard, donde ha enseñado cursos sobre estrategia, gobernanza corporativa y negocios internacionales.
Es autor de «Trust: Creating the Foundation for Entrepreneurship in Developing Countries» («Confianza: La creación de la base para el espíritu empresarial en los países en vías de desarrollo»), entre otros libros y artículos académicos.
Uno de ellos lo tituló: «Contextual Intelligence» y salió publicado en 2014 en Harvard Business Review, revista de la Escuela de Negocios de la Universidad de Harvard. Ese tipo de inteligencia la definió como «la habilidad para entender los límites de nuestro conocimiento y para adaptar ese conocimiento a un ambiente diferente del que se desarrolló».